Nach ihrem Studium in Marburg absolvierte Kerstin Hannig ihre Ausbildung zur Frauenärztin in Herford und der Klinik St. Hedwig in Regensburg. Hier legte sie 2002 ihre Facharztprüfung ab, bevor sie mehrere Jahre als Assistenzärztin und Funktionsoberärztin in St. Hedwig und der Kelheimer Goldbergklinik praktizierte.

Seit 2011 betreibt sie ihre eigene Frauenarzt-Praxis im Regensburger Stadtteil Kumpfmühl.

Kerstin Hannig ist Mitglied in der DGGG (Deutsche Gesellschaft für Gynäkologie und Geburtshilfe e.V.), dem BVF (Berufsverband der Frauenärzte Bayern e.V.), des Qualitätszirkels Gynäkologie Regensburg, der DMG (Deutsche Menopause Gesellschaft e.V.) und der Arbeitsgemeinschaft NATUM (Naturheilkunde, Akupunktur, Umwelt-und Komplementärmedizin).